di Redazione
LOCRI-“La Bioinformatica e la Nuova Medicina”, questo il titolo della conferenza che il professor Alfredo Ferro terrà il prossimo 11 aprile alle 14.00 presso l’aula magna del Liceo scientifico “Zaleuco” di Locri.
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L’evento, che si colloca nell’ambito del progetto extracurriculare “Agorà”, il cui tutor è il professor Giuseppe Giarmoleo, si aprirà con i saluti del dirigente scolastico Fazzolari a cui seguirà l’introduzione della studentessa Saporito per poi passare nel vivo con la relazione del prof.Ferro, esperto in Bioinformatica di fama mondiale, docente presso l’Università di Catania e ricercatore anche presso l’Università di New York.
Seguirà il dibattito e le conclusioni
Alfredo Ferro è nato a Ramacca (CT) il 10 maggio 1951. Ha conseguito la Laurea in Matematica presso l’Università di Catania nel 1973 con voti 110/110 e lode. Ha ottenuto il Ph.D. in Computer Science presso il Courant Institute della New York University nel 1981, discutendo una tesi dal titolo: Decision procedures for some classes of unquantified set-theoretic formulae. Per tale tesi riceve il premio Jay Krakauer Award per la migliore tesi Ph.D. nel campo delle Scienze per l’anno 1980/81 presso la New York University.
Dal 1990 è Professore Ordinario di Informatica presso la Facoltà di SMFN dell’Università di Catania. Egli e’ stato il promotore principale del Corso di Laurea in Informatica di Catania di cui e’ stato il primo Presidente ed in cui insegna ormai da diversi anni corsi di Basi di Dati, Data Analysis and Management e Bioinformatica . E’ stato coordinatore del Dottorato di Ricerca in Informatica dal 1996 al 2002. Attualmente fa parte del Dipartimento di Medicina Clinica e Sperimentale ed è stato promotore del dottorato in Biologia, Genetica Umana e Bioinformatica,coordinatore del Dottorato in Patologia Clinica, Molecolare e Computazionale ed è attualmente coordinatore del Dottorato in Biomedicina Molecolare.E’ direttore della J.T.Schwartz Inernational School for Scientific Research a Lipari. E’ co-direttore dealla nuova Lipari International Summer School on BioInformatics and Computational Biology.
E’ stato coordinatore del progetto triennale di Internazionalizzazione INT01AB7BE tra le Universita’ di Catania, New York University e Columbia University. La sua area di ricerca include Database,DataMining and Algorithms with applications to Bioinformatics and Networking. Il suo gruppo di ricerca ha trattato temi di Computational RNAi and Network Biology.In particolare microRNA targeting, A-to-I editing e circulating microRNA . Ha studiato endogenous and artificial RNA-based therapy for biomedical applications in collaborazione con il Prof.Carlo Croce, Columbus,OH, Prof. Charles Lawrence, Brown University and Prof.Dennis Shasha New York University). Per quanto riguarda computational Network Biology il suo gruppo ha prodotto algoritmi e software efficienti per exact and approximate subgraph searching in large Networks or in large Database of Networks (In collaborazione con Prof.Dennis Shasha ,New York University,Prof.Roded Sharan, Tel Aviv University, Prof Gary Bader, University of Toronto).
PUBBLICAZIONI (Ultimi 3 anni)
-Laganà A, Acunzo M, †, Romano G, Pulvirenti A, Veneziano D, Cascione L, Giugno R, Gasparini P, Shasha D, Ferro A, Croce C M (2014). miR-Synth: a computational resource for the design of multi-site multi-target synthetic miRNAs. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, ISSN: 1362-4962, doi: doi: 10.1093/nar/gku202
Russo F, Di Bella S, Nigita G, Macca V, Laganà A, Giugno R, Pulvirenti A, Ferro A (2012). miRandola: Extracellular Circulating MicroRNAs Database. PLOS ONE, vol. 7, ISSN: 1932-6203, doi: doi:10.1371/journal.pone.0047786
Laganà A, Russo F, Veneziano D, Di Bella S, Pulvirenti A, Giugno M, Croce C M, Ferro A (2013). Extracellular circulating viral microRNAs: current knowledge and perspectives. FRONTIERS IN GENETICS, ISSN: 1664-8021, doi: 10.3389/fgene.2013.00120
.Alaimo S, Pulvirenti A, Giugno R, Ferro A (2013). Drug-Target interaction prediction through Domain-Tuned Network Based Inference. BIOINFORMATICS, ISSN: 1367-4803, doi: 10.1093/bioinformatics/btt307
-Russo F, Di Bella S, Bonnici V, Laganà A, Rainaldi G, Pellegrini M, Pulvirenti A, Giugno R, FERRO A (in stampa). A knowledge base for the discovery of function, diagnostic potential and drug effects on cellular and extracellular miRNAs. BMC GENOMICS, ISSN: 1471-2164
-Rocci A, Hofmeister CC, Geyer S, Stiff A, Gambella M, Cascione L, Guan J, Benson DM, Efebera YA, Talabere T, Dirisala V, Smith EM, Omedè P, Isaia G, De Luca L, Rossi D, Gentili S, Uccello G, Consiglio J, Ria R, Benevolo G, Bringhen S, Callea V, Weiss B, Ferro A, Magarotto V, Alder H, Byrd JC, Boccadoro M, Marcucci G, Palumbo A, Pichiorri F (2014). Circulating miRNA markers show promise as new prognosticators for multiple myeloma.. LEUKEMIA, ISSN: 0887-6924, doi: 10.1038/leu.2014.155
Laganà A, Paone A, Veneziano D, Cascione L, Gasparini P, Carasi S, Russo F, Nigita G, Macca V, Giugno R, Pulvirenti A, Shasha D, Ferro A, Croce C M (2012). miR-EdiTar: A database of predicted A-to-I edited miRNA target sites. BIOINFORMATICS, vol. 28, p. 3166-3168, ISSN: 1367-4803, doi: 10.1093/bioinformatics/bts581
-Micale G, Pulvirenti A, Giugno R, Ferro A (2014). GASOLINE: a Greedy And Stochastic algorithm for Optimal Local multiple alignment of Interaction NEtworks. PLOS ONE, vol. June 9, ISSN: 1932-6203
Bonnici V, Giugno R, Pulvirenti A, Shasha D, Ferro A (2013). A subgraph isomorphism algorithm and its application to biochemical data. BMC BIOINFORMATICS, ISSN: 1471-2105, doi: 10.1186/1471-2105-14-S7-S13
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Giugno R, Bonnici V, Bombieri N, Pulvirenti A, Ferro A, Shasha D (2013). GRAPES: A Software for Parallel Searching on Biological Graphs Targeting Multi-Core Architectures. PLOS ONE, vol. 8, ISSN: 1932-6203, doi: 10.1371/journal.pone.0076911
-Cascione L, Gasparini P, Lovat F, Carasi S, Pulvirenti A, Ferro A, Alder H, He G, Vecchione A, Croce C M, Shapiro C L, Huebner K (2013). Integrated MicroRNA and mRNA Signatures Associated with Survival in Triple Negative Breast Cancer. PLOS ONE, vol. 8, ISSN: 1932-6203, doi: doi:10.1371/journal.pone.0055910
-Giugno R, Pulvirenti A, Pigola G, Ferro A (2013). MIDClass:Microarray Data Classification by Association Rules and Gene Expression Intervals. PLOS ONE, ISSN: 1932-6203, doi: 8:e69873
Distefano R, Nigita G, Macca V, Laganà A, Giugno R, Pulvirenti A, Ferro A (2013). VIRGO: visualization of A-to-I RNA edi
